カラーレンジを反映して画像を保存する

連番画像（8bit）を読み込み，指定のカラ―レンジを反映させてカラー画像として保存したいです．

やりたいこと

①．表示上のカラーレンジの指定

②．閾値以下の値をノイズとして黒にする．

　（⇒カラーレンジを0～255とすると．10以下をすべて黒色に変換する）

③．①②を反映した画像を保存する．

下記のスクリプトを例として修正したいと思います．

for n= 1:5 
  IMG = imread (['アドレス\No',num2str(n),'.tif']); %画像読みこみ．．IMGは8bit
   
    %保存時に反映したいレンジ★
      colormap(jet)
      cmin =　50;
      cmax = 255;
      caxis([cmin cmax]); 
      colorbar 
  
   %画像保存．この設定だとカラーレンジは自動＝0～255(MIN MAX)．↑★の設定は反映されない
   newmap=colormap(jet); 
   imwrite(IMG,newmap,['アドレス\Color_No',num2str(n),'.tif']); 
   
end

Answer 1

[Shunichi Kusano]

次の方法がありそうです。

1．exportgraphics関数を使う

　この方法だとfigureで表示したままの絵が保存できますし、簡単です。が、こちらで試してみたところ axis offにしてもわずかですが周囲に背景色が残ってしまいます。試してみて気になるようであれば次の方法が良いかと思います。

2．インデックス付きイメージとして保存

　詳しくは公式ドキュメントの通りですが、やり方としての手順は次の通りです。

1. 50-255をインデックス付きイメージに変換（0-1にrescaleして205倍して＋１する）
2. 元の画像で10以下のところを0に。
3. [0 0 0;jet(206)]でカラーマップを作成
4. imwriteで上記インデックス画像とカラーマップを保存

% パラメータ決定
cmin = 50;
cmax = 200;
th = 10;
% リスケールしてインデックス画像に変換
imq = rescale(im,"InputMin",cmin,"InputMax",cmax);
imq = uint8(imq * (cmax-cmin)) + 1;
imq(im <= th) = 0; % ノイズ処理
% カラーマップの定義（ゼロは黒、それ以外はjet）
cmap = [0 0 0;jet(cmax-cmin+1)];
% 保存
imwrite(imq,cmap,'test.png');

[H.O]

ご丁寧な回答ありがとうございます。 頂いた1, 2 どちらも確認できました。 exportgraphics関数だと、カラーバーやレジェンド等も画像に反映させることができて期待以上でした。 ありがとうございました。