SimBiology
Modellazione, simulazione e analisi di sistemi biologici
Hai domande? Contatta l’ufficio commerciale.
SimBiology fornisce app e strumenti programmatici per modellare, simulare e analizzare sistemi dinamici, concentrandosi sulla farmacologia quantitativa dei sistemi (QSP) e su applicazioni farmacocinetiche basate sulla fisiologia (PBPK) e farmacocinetiche/farmacodinamiche (PK/PD). Consente di creare modelli in modo interattivo usando l’editor di diagrammi a blocchi di SimBiology oppure in modo programmatico con il linguaggio MATLAB. È possibile creare i propri modelli partendo da zero, importarli come file formattati SBML oppure costruirli sulla base degli esempi contenuti in SimBiology.
SimBiology offre una varietà di tecniche per analizzare i modelli basati su ODE a diversi livelli di complessità e dimensioni. È possibile eseguire simulazioni per valutare la fattibilità del target, prevedere l’efficacia e la sicurezza di un farmaco e individuare programmi di dosaggio ottimali. È possibile individuare parametri e percorsi chiave servendosi di analisi di sensibilità globale e locale e valutare la variabilità biologica tramite l’esecuzione di sweep dei parametri. Per stimare i parametri, è possibile eseguire il fitting dei dati usando la regressione non lineare e tecniche a effetti misti non lineari, oltre a eseguire analisi non compartimentali (NCA).
Costruzione di modelli QSP, PBPK e PK/PD
Costruisci modelli proprio come se li stessi disegnando su un foglio di carta usando SimBiology Model Builder oppure importando modelli SBML esistenti. Usa gli oggetti dose e variant per applicare strategie di dosaggio (10:00) e salvare valori di quantitativi alternativi.
Simulazione del comportamento del modello
Simula utilizzando una varietà di risolutori deterministici e stocastici con SimBiology Model Analyzer o degli strumenti programmatici. La conversione automatica delle unità porta tutte le quantità in un sistema di unità di misura coerente. Genera report a partire dalle analisi.
Adattamento dei dati per stimare parametri
Stima i parametri usando la regressione non lineare con metodi locali, globali o ibridi. Calcola gli intervalli di confidenza dei parametri e delle previsioni. Non dimenticarti degli effetti fissi e casuali con la modellazione NLME.
Esecuzione di simulazioni Monte Carlo
Esegui scansioni di parametri e simulazioni Monte Carlo per valutare il comportamento del modello in condizioni e regimi di dosaggio differenti. Usa cursori interattivi per esplorare l’entità dell’impatto delle variazioni delle quantità sulla risposta del modello.
Analisi di sensibilità globale e locale
Esplora gli effetti delle variazioni nelle quantità di modellazione sulla risposta del modello eseguendo analisi di sensibilità. SimBiology supporta analisi basate su derivate globali, Monte Carlo e locali.
Analisi non compartimentali
Calcola i parametri PK dal decorso temporale delle concentrazioni dei farmaci senza presupporre un modello compartimentale. Esegui le NCA sia sui dati sperimentali che su quelli di simulazione per il dosaggio singolo o multiplo.
Accelerazione delle simulazioni
Accelera le simulazioni Monte Carlo o di modelli di grandi dimensioni con la conversione in codice C compilato. Migliora ulteriormente le prestazioni tramite la distribuzione su più core, cluster o risorse Cloud con Parallel Computing Toolbox.
Condivisione di modelli tramite app web
Crea app usando App Designer, inseriscile in un pacchetto con MATLAB Compiler e ospitale con MATLAB Web App Server. I collaboratori possono accedere alle app ed eseguirle in un browser senza dover installare dei software.
Strumenti della community
Usa SimBiology in modo programmatico con gli script MATLAB per personalizzare e automatizzare le analisi. Gli strumenti creati dalla community possono essere usati come componenti aggiuntivi per l’analisi dei modelli, come le simulazioni di popolazioni virtuali.
Risorse sui prodotti:
Richiedi una versione di prova gratuita
30 giorni di prova a tua disposizione.
Pronto per acquistare?
Richiedi una quotazione e scopri i prodotti correlati.
Sei uno studente?
È possibile che la tua scuola già fornisca accesso a MATLAB, Simulink e ad altri prodotti complementari mediante una Campus-Wide License.
