Simulink Control Design consente di progettare e analizzare sistemi di controllo tradizionali e basati sui dati modellati in Simulink. Offre strumenti per trovare punti operativi e calcolare linearizzazioni esatte di modelli Simulink in varie condizioni operative. È possibile calcolare le risposte in frequenza dei sistemi basate sulla simulazione. Inoltre è possibile implementare algoritmi di stima embedded per stimare in tempo reale la risposta in frequenza degli impianti fisici.

Simulink Control Design regola automaticamente architetture di controllo SISO e MIMO arbitrarie, compresi controllori PID e compensatori gain-scheduled. È possibile distribuire algoritmi di ottimizzazione automatica PID nel software embedded per calcolare automaticamente i guadagni PID in tempo reale. Simulink Control Design consente di progettare e implementare il controllo sliding mode, il controllo per apprendimento iterativo, il controllo di reiezione dei disturbi attivi e altri algoritmi di controllo non lineari, adattivi e basati sui dati. È possibile utilizzare i metodi di applicazione dei vincoli per regolare le azioni di controllo, evitando che il sistema violi i vincoli fondamentali.