Simulink Control Design consente di progettare e analizzare sistemi di controllo modellati in Simulink. È possibile regolare automaticamente architetture di controllo SISO e MIMO arbitrarie, compresi i controller PID. La sincronizzazione automatica PID può essere implementata nel software embedded per calcolare automaticamente i guadagni PID in tempo reale. È inoltre possibile implementare algoritmi di controllo di reiezione dei disturbi attivi, di controllo della ricerca degli estremi e di controllo adattivo di riferimento dei modelli per le applicazioni in cui il controller deve adattarsi alla dinamica mutevole dell’impianto e dei disturbi.

È possibile trovare punti operativi e calcolare linearizzazioni esatte di modelli Simulink in varie condizioni operative. Simulink Control Design fornisce strumenti che consentono di calcolare risposte in frequenza basate sulla simulazione senza modificare il modello.